凌霄殿的进一步建设以及展陵和何青青的婚事都在密锣紧鼓地筹备中，从身为殿主的秦远，到方来漠洲还没站稳脚跟的庇护城武者，都在忙碌之中或者在忙碌的路上。

经过半个月的时光，凌霄殿的编制已基本完成。

凌霄殿设置殿主一人，由秦远出任；副殿主一人，由展陵出任。殿主和副殿主统领整个凌霄殿，拥有最终决定权。

同时，凌霄殿设置内阁，成员除了秦远和展陵以外，还有陆长羚、商夏、何丹丹、何青青和唐千柔。内阁主要处理凌霄殿各项重大事务，除了必须殿主和副殿主亲自拍板的事项，可在两位殿主不参与的情况下做出决议。

秦远曾经想过削减殿主的权力，以防止未来凌霄殿殿主更迭后，殿主专断一切，但想到这个世界还不具备这种条件，分化殿主权力反而容易导致凌霄殿分崩离析，便打消了这个念头。

内阁以下，按职能设置了七大阁：

丹阁：由擅长炼制丹药、研究毒物的人才组成，在满足凌霄殿成员的使用需求情况下，还会炼制丹药毒药对外销售。唐千柔作为用毒的行家，便当仁不让地担任起了丹阁的阁主。

圣印阁：由圣印师组成，按照凌霄殿的赏罚制度，给予成员提升武印星级的奖励，阁主由丹武学院圣印系首席颛孙国傲担任。

千机阁：由千机师、傀儡师组成，目前的主力都是丹武学院沐心妍带来的那一批千机师，主要研究机关造物、傀儡术，由沐心妍担任阁主。值得一提的是，当初指点过秦远解救齐琪方法的傀儡师郑信和沐心妍正在联合研发机关傀儡。

经贸阁：正如其名，主要负责贸易方面的事务，管理凌霄殿的财务，为凌霄殿的发展提供经济支持。广粤商会原班人马直接成为了经贸阁的主要成员，会长赵博担任阁主。

藏书阁：类似于地球中少林寺的藏经阁，由千机阁设计了重重机关防卫，存放着从各种途径收集而来的功法、武技、心得等典籍。在构想之初，秦远还苦恼不知由谁来担任藏书阁的阁主，如今庇护城全体到来，他说服了云守一出任。不过，比起其他阁，藏书阁是最为闲散、人员最少的。

还有铸造阁和阵术阁，暂时还没有足够的人才，因此未定阁主，只能等将来招募到更多的人后再行设置。

除了七大阁以外，凌霄殿还设置了独立的刑堂，专司凌霄殿内的刑罚。在展陵的推荐下，秦远决定任用正直的李骞担任刑堂的堂主。

同时，凌霄殿设置了没有实权的长老院